Zespół łamliwego chromosomu X znany jako FXS OMIM 300624 jest chorobą genetyczną powiązaną z chromosomem X, która wynika głównie z patologicznego rozszerzenia trójki nukleotydów CGG oraz nieprawidłowej metylacji regionu promotora. Zestaw Adellgene Fragile X Screening to półautomatyczne rozwiązanie przeznaczone do użytku w laboratoriach klinicznych, służące do bardzo precyzyjnego i ilościowego oznaczania powtórzeń w nieprzetłumaczonym regionie 5 prim genu FMR1.
Choroba FXS występuje z częstością 1 na 4000 mężczyzn oraz 1 na 8000 kobiet. Osoby dotknięte tą chorobą wykazują charakterystyczne cechy fenotypowe takie jak duże uszy i wyraźna szczęka. W zależności od wyliczonej liczby powtórzeń analizowanej trójki nukleotydów można precyzyjnie przypisać pacjenta do jednej z czterech kategorii klinicznych:
- Mniej niż 45 powtórzeń: Osoby ze zdrowymi allelami.
- Od 45 do 54 powtórzeń: Osoby z allelami pośrednimi.
- Od 55 do 200 powtórzeń: Osobniki z allelami premutacyjnymi.
- Ponad 200 powtórzeń: Osoby z pełnymi allelami mutacyjnymi.
Zestaw przesiewowy jest idealnie zoptymalizowany do oznaczania liczby powtórzeń obecnych u zdrowych osób oraz u pacjentów obciążonych premutacją. Ważnym aspektem analitycznym jest to, że próbki od kobiet wykazujące tylko jeden szczyt w elektroferogramie oraz próbki od mężczyzn całkowicie pozbawione szczytu muszą być rygorystycznie analizowane za pomocą innych uzupełniających technik. Odpowiednią metodą będzie tu na przykład system oparty na TP-PCR, który ma za zadanie ostateczne potwierdzenie braku w pełni zmutowanego allelu o długości powyżej 200 powtórzeń CGG.
Technologia tego systemu diagnostycznego opiera się na wydajnej amplifikacji DNA genomowego wyekstrahowanego bezpośrednio z krwi obwodowej za pomocą tradycyjnej reakcji łańcuchowej polimerazy PCR, a następnie na czułej analizie fluorescencyjnej generowanych fragmentów.
| Cecha | Specyfikacja |
|---|
| Metoda analityczna | Reakcja PCR z fluorescencyjną analizą fragmentów |
| Materiał wejściowy | Genomowe DNA wyekstrahowane z krwi obwodowej pacjenta |
| Cel badawczy | Nieprzetłumaczony region 5 prim genu FMR1 |
| Kompatybilność platform | Analizatory ABI 3130, ABI 3730, ABI 3500 oraz SeqStudio |
Zestaw dostarcza nieocenionej wiedzy, pozwalając sprawnie sklasyfikować pacjentów ze zdrowymi allelami oraz tych będących nosicielami niebezpiecznej premutacji. Bezpośrednio wspiera to diagnozę zespołu łamliwego chromosomu X, a także ocenę powiązanych schorzeń, takich jak upośledzenie umysłowe, pierwotna niewydolność jajników i zespół drżenia i ataksji.
Połączenie precyzyjnej amplifikacji materiału z odczytem rozmiarów fragmentów PCR na rutynowych analizatorach sprzętowych pozwala przeliczyć te rozmiary na odpowiednią liczbę powtórzeń CGG z bardzo dużą pewnością analityczną.
Produkt przeznaczony jest do rutynowego użytku przez wyszkolony personel laboratoryjny, a jego specjalnie opracowana konstrukcja mocno przyspiesza procesy przesiewowe w codziennej pracy nowoczesnego zakładu diagnostyki genetycznej.