CF StripAssay® EXT firmy ViennaLab to zestaw diagnostyczny CE-IVD przeznaczony do rozszerzonej, ukierunkowanej analizy mutacji w genie CFTR (Cystic Fibrosis Transmembrane Conductance Regulator). Test opiera się na amplifikacji PCR oraz hybrydyzacji odwrotnej na paskach StripAssay®.
Wariant EXT obejmuje 38 najczęstszych mutacji CFTR oraz warianty IVS8 polyT 5T/7T/9T występujące w populacji kaukaskiej. Zestaw może wspierać genetyczne potwierdzenie obecności mutacji CFTR u pacjentów z podejrzeniem mukowiscydozy, diagnostykę drugiego lub trzeciego rzutu w programach przesiewowych noworodków oraz ocenę nosicielstwa mutacji CFTR u krewnych pacjentów, dorosłych w wieku rozrodczym i w populacji ogólnej.
Zestaw obejmuje 38 mutacji genu CFTR oraz warianty IVS8 polyT 5T/7T/9T:
- CFTRdele2,3(21kb)
- E60X
- G85E
- 394delTT
- E92X
- E92K
- R117H
- 621+1G>T
- 1078delT
- R334W
- I336K
- R347H
- R347P
- IVS8 5T / 7T / 9T
- A455E
- I507del
- F508del
- 1677delTA
- 1717-1G>A
- G542X
- G551D
- R553X
- 2043delG
- 2143delT
- 2183AA>G
- 2184delA
- 2184insA
- 2789+5G>A
- 3120+1G>A
- 3272-26A>G
- Y1092X
- M1101K
- R1158X
- R1162X
- 3659delC
- 3849+10kb C>T
- 3905insT
- W1282X
- N1303K
Mukowiscydoza jest chorobą autosomalną recesywną wynikającą z mutacji w genie CFTR, które wpływają na strukturę, funkcję lub produkcję białka kanału chlorkowego. Choroba może obejmować układ oddechowy, trzustkę, przewód pokarmowy oraz układ rozrodczy.
Łagodniejsze zaburzenia związane z CFTR mogą mieć postać jednostek klinicznych niespełniających pełnych kryteriów mukowiscydozy, takich jak wrodzony obustronny brak nasieniowodów (CBAVD), rozsiane rozstrzenie oskrzeli lub przewlekłe zapalenie trzustki.
Wynik badania powinien być interpretowany łącznie z obrazem klinicznym, wywiadem rodzinnym, wynikami badań biochemicznych, testem potowym oraz innymi informacjami diagnostycznymi. Producent wskazuje, że CF StripAssay® EXT nie jest przeznaczony jako samodzielny test diagnostyczny w mukowiscydozie.
Technologia ViennaLab StripAssay® obejmuje izolację DNA, amplifikację PCR z użyciem biotynylowanych starterów oraz hybrydyzację produktów PCR z allelospecyficznymi sondami unieruchomionymi na paskach testowych. Związane sekwencje są wykrywane przy użyciu streptawidyny sprzężonej z fosfatazą alkaliczną oraz substratów barwnych.
W przypadku CF StripAssay® EXT dla każdej próbki wykonywane są dwie oddzielne reakcje PCR: A i B. Produkty amplifikacji są następnie analizowane na dwóch paskach: Teststrip A i Teststrip B.
| Cecha | Specyfikacja |
|---|
| Metoda analityczna | PCR + reverse-hybridization |
| Technologia | ViennaLab StripAssay® |
| Materiał badany | DNA z krwi obwodowej lub suchej kropli krwi |
| Gen docelowy | CFTR |
| Obszar diagnostyczny | Mukowiscydoza, zaburzenia CFTR-zależne, nosicielstwo CFTR |
| Liczba analizowanych mutacji | 38 mutacji CFTR |
| Dodatkowe warianty | IVS8 polyT 5T/7T/9T |
| Liczba reakcji PCR na próbkę | 2 reakcje: A i B |
| Liczba pasków na próbkę | 2 paski: Teststrip A i Teststrip B |
| Formaty zestawu | 10 testów, 24 testy, 5 testów trial |
| Temperatura przechowywania | 2–8°C |
| Status produktu | CE-IVD / IVDR |
Zestaw obejmuje 38 najczęstszych mutacji genu CFTR oraz warianty IVS8 polyT 5T/7T/9T, istotne w diagnostyce mukowiscydozy i zaburzeń CFTR-zależnych.
Zakres wariantów został dobrany pod kątem najczęstszych mutacji CFTR występujących w populacji kaukaskiej.
Test może wspierać genetyczne potwierdzenie obecności mutacji CFTR u pacjentów z podejrzeniem mukowiscydozy.
CF StripAssay® EXT może być stosowany do oceny nosicielstwa mutacji CFTR u krewnych pacjentów, dorosłych w wieku rozrodczym oraz w populacji ogólnej.
Zestaw może być stosowany z DNA izolowanym z krwi obwodowej lub z suchej kropli krwi, co wspiera zastosowanie w kontekście badań przesiewowych noworodków.
Połączenie amplifikacji PCR i hybrydyzacji paskowej pozwala na interpretację wyniku na podstawie wzoru prążków na dwóch paskach testowych.